衡水县城的学籍和主城区学籍中考时不同之处在于，县城学籍的学生教育资源相对有限，其教学水平和教育质量也相对较低，因此其中考难度可能会相对较低一些。

而主城区学籍的学生教育资源相对充足，其教学水平和教育质量也相对较高，因此其中考难度可能会相对较大一些。同时，县城学籍的学生在备战中考时可能会面临交通、住宿等方面的困难，需要更多的努力和资源支持。