有影响。职工医保有个人账户，个人账户有钱新农合虽有个人账户，但个人账户没有钱。职工医保是国家依法保障职工的权利，具有强制性，每个月个人和单位必须缴纳，可以到药店买药等。

新农合是自愿缴费，每年只交一次，个人账户没有钱，即不可以到药店买药，必须到医院看病，才能扣除相应费用。职工医保转新农合，不划算。