万奎士13轴和11轴的主要区别在于其结构和应用。

13轴的设计通常更复杂，拥有更多的轴承和支撑点，因此可以提供更高的精度和稳定性。这使得13轴在需要高精度和高稳定性的应用中表现更佳，例如在高速机床、精密测量设备等领域。

而11轴则相对简单，结构紧凑，通常用于一些对精度和稳定性要求不那么高的场合，例如一些简单的机械传动、自动化生产线等。

总之，万奎士13轴和11轴各有其优缺点，选择哪种轴需要根据具体的应用需求来决定。