单元门禁主机的设置方法主要包括以下几个步骤：

首先，将主机的电源线和网线接好，开机后登录管理界面，设置管理员账号和密码。

然后，添加门禁设备并设置对应的门禁参数，如开门时间、反潜时间等。

接着，配置开门权限，可以设置卡片权限、密码权限等。

最后，设置报警参数，如非法开门报警、防拆报警等。完成以上设置后，测试门禁设备是否正常工作，确保门禁系统的安全性和可靠性。