昆明农行商户e贷的申请流程如下：

登录农行网上银行或手机银行，进入“贷款”菜单，点击“商户e贷”进行申请。

确认申请信息准确无误后，插入K宝进行身份验证，并提交申请。

等待农行对提交的资料进行审核和信用评估。

审核通过后，银行会核定贷款额度，并通知申请人签署相关合同。

贷款发放后，申请人需按照协议约定的还款计划进行按期还款。

在申请过程中，需要上传一些必要的资料，如营业执照、税务登记证、组织机构代码证等。同时，申请人需要满足农行的征信要求，如当前无逾期，近2年内逾期或欠息次数在一定范围内等。

请注意，务必遵守合同规定，以免发生不必要的罚息和逾期等后果。如有任何疑问或需要进一步的帮助，建议直接联系农行的工作人员或访问农行官网以获取最新、最准确的信息。