五十音图有两个版本主要是因为发音的规则和语言习惯的不同。在日语中，五十音图是学习日语的基础，它包含了所有的日语发音字母和假名。

对于日本本土的日语教育来说，一般使用的是平假名和片假名两个版本。平假名主要在日常生活中使用，而片假名则主要在书写外来词和特殊词汇时使用。

此外，在中国等其他国家，由于日语教育历史和语言习惯的不同，也出现了不同的版本。这些版本在发音和书写上略有差异，但总体上都是为了帮助学习者更好地掌握日语的发音和书写。

总的来说，五十音图有两个版本主要是因为日语的语言习惯和历史背景的不同。但是无论使用哪个版本，只要能够正确掌握日语的发音和书写，就可以顺利地学习和使用日语。