西千佛洞和莫高窟都是中国著名的古代石窟艺术遗址，但它们有以下几个区别：

1. 位置不同：西千佛洞位于甘肃省酒泉市敦煌市境内，而莫高窟位于甘肃省酒泉市敦煌市郊区的龟兹山南部。

2. 规模不同：莫高窟是中国保存最完整、规模最大的佛教艺术宝库之一，共有洞窟492个，壁画和彩塑数量众多，保存较为完好。而西千佛洞则是敦煌石窟中保存较好的一个，共有22个洞窟，规模相对较小。

3. 艺术风格不同：莫高窟的壁画和彩塑多样而精美，风格主要为唐代和宋代的宗教艺术；而西千佛洞的壁画则以北魏和唐代的壁画为主，风格较为古朴，具有浓郁的北方艺术风格。

4. 历史背景不同：莫高窟建于4世纪至14世纪，历经北魏、西魏、北周、隋、唐、五代、西夏、元、明、清等时期的建造和维修；而西千佛洞建于北魏时期，是由当时的敦煌郡太守王澄委托造像师所建，是中国最早的石窟之一。

综上所述，虽然西千佛洞和莫高窟都是中国著名的石窟艺术遗址，但它们在位置、规模、艺术风格和历史背景等方面都存在不同。