如果新能源车辆发生自燃，造成车主的损失，应该由厂家或者销售商承担赔偿责任。根据《产品质量法》规定，因产品存在缺陷造成人身、他人财产损害的，受害人可以向产品生产者要求赔偿，也可以向产品销售者要求赔偿。

因此，当新能源车辆发生自燃时，车主可以先联系厂家或者销售商进行协商处理，要求对方赔偿自己的损失。如果无法达成一致意见，车主还可以通过法律途径维护自己的合法权益。