肉质和风味。新疆羊肉通常来自细毛羊和细尾羊，肉质瘦而结实，富含维生素B和蛋白质，风味浓郁，带有草本芳香；蒙古羊肉则肉质更柔嫩，因为生长在寒冷环境中，需要更多脂肪来保暖，风味呈现出嫩滑和清淡的特点1。

毛色。蒙古羊的毛色以黄白相间为主，而新疆羊的毛色以白色、黑色为主，尤其是黑色多且毛发粗长浓密2。

营养价值。新疆羊肉脂肪含量较高，而蒙古羊肉蛋白质含量更高12。

烹饪方式。新疆羊肉常作为烤肉的主食，而蒙古羊肉更适合做成火锅、涮羊肉或煮着食用1。

选材和烤制方式。新疆羊肉串会选择较硬的部位，如羊肩胛肉，而蒙古羊肉串则使用较均匀的部位，如整个羊肉腿或肋骨，烤制方式上，新疆烤串味道焦香，口感略带焦脆，而蒙古烤串则以鲜美入味、肉质细嫩为主3。