支付宝申请灵活就业社保后，用户需要在支付宝中选择“缴费”并填写相关信息，如缴费起止时间、缴费基数等。缴费方式可以选择支付宝余额、银行卡等。

缴费成功后，用户可以在“社保”模块中查询缴费记录和社保缴纳情况。值得注意的是，用户需要按时缴纳社保费用，否则会影响社保待遇的享受。