往来科目出现赤字时，通常意味着企业的资金流入和流出之间存在不平衡，导致资金短缺或债务过高。为了解决这一问题，企业可以采取以下措施：

深入分析赤字原因：首先要对往来科目的赤字进行深入分析，了解是由于应收账款无法及时收回、应付账款过多、预付账款无法转为成本等原因造成的。只有明确了赤字的具体原因，才能有针对性地采取措施。

加强应收账款管理：对应收账款进行定期清理和催收，确保客户按时支付款项。对于长期拖欠的客户，可以考虑采取法律手段进行追讨。

优化应付账款管理：与供应商协商合理的付款期限和方式，避免一次性支付大额款项。同时，加强对应付账款的审核和控制，确保付款的准确性和及时性。

调整预付账款策略：对于预付账款，要严格控制其规模和比例，避免过多的资金占用。同时，加强对预付账款的跟踪和管理，确保其能够按时转化为成本或收入。

建立风险预警机制：通过建立风险预警机制，实时监控往来科目的变动情况，一旦发现异常情况及时采取措施进行处理。

提高财务管理水平：加强财务管理人员的培训和学习，提高其专业素养和管理能力。同时，建立完善的财务管理制度和流程，确保财务管理的规范化和高效性。

总之，解决往来科目赤字需要企业从多个方面入手，加强应收账款、应付账款、预付账款的管理和控制，建立风险预警机制，提高财务管理水平。

只有这样，才能确保企业的资金流动保持平衡，实现稳健经营和发展。