南京工程学院电气自动化专业与国外合作自动化的区别在于，南京工程学院与英国诺森比亚大学采取“ 3+1 ”的培养方式，合作举办电气工程及其自动化专业本科教育项目；与芬兰奥卢大学采取“ 4+0 ”的培养方式，合作举办软件工程专业本科教育项目。