如果社保停保了但仍然扣费，可能有几种原因。

首先，可能是由于系统错误或延迟导致的。在这种情况下，您可以联系社保部门或相关机构，向他们说明情况并要求退款。

其次，可能是由于您的停保申请尚未被处理或记录不完整。您可以核实您的停保申请是否已被接受，并确保所有必要的文件和信息已提交。

最后，还有可能是由于其他费用或扣款项目导致的误解。您可以仔细检查扣款明细，确认是否有其他费用或扣款项目与社保无关。如果问题仍然存在，建议您咨询专业人士或法律顾问以获取更详细的帮助。