使用补漆笔后，去4S店补漆可能会有一些影响。4S店通常会使用专业的喷涂技术和设备来进行补漆，以保证修复效果的质量和持久性。而补漆笔相比之下，虽然方便简单，但很难达到完美的修复效果。

因此，如果您用补漆笔自己补漆后去4S店进行进一步修复，可能会被4S店的技师发现修复痕迹或不同凹凸度的问题。这可能会影响4S店对您的服务态度和质量保修。

建议：如果您对车辆的外观有较高的要求，最好直接将问题反馈给4S店，并让他们使用专业的喷涂技术进行修复。这样可以保证修复效果更为理想，且在服务保修范围内。