如果两个人合伙开了美甲店，其中一人想要撤资，可以按照以下步骤进行：

1. 协商解除合伙关系：两个合伙人应当协商解除合伙关系，确定撤资方的退出方式和撤资金额。

2. 修改合伙协议：根据协商结果，修改合伙协议，明确撤资方的退出时间、退出方式和撤资金额等相关事项。

3. 办理相关手续：撤资方应当办理相关手续，包括注销个人工商户、解除与美甲店的劳动合同、清算个人财务等。

4. 分配财产：根据协商结果，将美甲店的财产进行分配，包括撤资方的投资本金和利润分成等。

需要注意的是，撤资方应当在合法合规的前提下进行撤资操作，避免违反相关法律法规。同时，撤资操作可能会对美甲店的经营产生影响，应当谨慎处理。