被朱元璋软禁致死。原本，朱元璋打算处死朱文正，但由于马皇后为其求情，朱文正才免于一死。然而，朱文正在被软禁后不久便去世了。朱文正是在1365年去世的，距洪都之战仅不到两年时间。