双路机箱与普通机箱在多个方面存在显著差异。首先，从内部设计来看，双路机箱是为了提高服务器的处理能力而特别设计的，内置有两个独立的服务器主板，每个主板都能独立运行和管理，这种设计不仅增强了服务器的稳定性和可靠性，还确保了数据的安全性和连续性。相比之下，普通机箱则通常采用单一主板设计。

其次，双路机箱的内部结构更为紧凑，主板间的布局更为合理，有助于提升散热能力，保证服务器的稳定运行。此外，由于双路机箱需要容纳两个主板以及相应的散热器和风扇，其体积通常会比普通机箱大一些。

综上所述，双路机箱与普通机箱在内部结构、设计理念以及使用场景上均有所不同。如果你需要进行高性能计算、处理海量数据或运行大型数据库等任务，双路机箱无疑是一个更好的选择。