彩色小水印变成透明底的方法是使用Photoshop或类似的图像编辑软件，选择魔术棒工具，选中水印的颜色，右键选择相应的选项得到选中的区域。

然后，选择透明度选项，调整透明度为适当程度，使水印看起来透明。

最后，保存文件为PNG格式。在PNG格式中，透明度会被保留，因此它可以覆盖到任何颜色的背景，避免了原本存在的问题。这样，彩色小水印就可以被成功地变成透明底。