EM菌和菌方都是微生物制剂，它们在农业、环保、畜牧业等领域都有广泛的应用。然而，具体哪个更好取决于具体的应用场景和需求。

EM菌是一种复合微生物菌剂，由多种有益微生物组成，如乳酸菌、酵母菌、光合细菌等。它具有促进植物生长、提高植物免疫力、改善土壤环境等多种功能。因此，在农业种植、园艺、畜牧业等领域，EM菌被广泛应用。

菌方则是一种针对特定问题的微生物制剂，通常由一种或多种特定的微生物组成。菌方的设计和应用需要针对具体的问题和需求进行定制，因此其效果和应用范围通常比EM菌更加专业和具体。例如，针对某种特定病原菌的菌方，可以更有效地控制病害的发生和传播。

因此，无法简单地说EM菌和菌方哪个更好。在实际应用中，需要根据具体的问题和需求选择合适的微生物制剂。如果需要促进植物生长、改善土壤环境等，EM菌可能是一个不错的选择；而针对特定的病原菌或环境问题，菌方可能更加适合。

总之，选择微生物制剂时，需要根据具体的应用场景和需求进行评估和选择。同时，也需要注意产品的质量和安全性，以确保其在实际应用中的效果和安全性。