港澳通行证和护照是两种不同的旅游证件，使用它们来跨境旅游时有些区别，但是它们之间并不会产生影响。

具体来说，持有中国护照的旅客可以前往大多数国家旅游，而持有港澳通行证的旅客主要是去往香港、澳门、台湾等地旅游。出入境时，根据目的地不同，可以选择使用护照或港澳通行证进行边境检查。

需要说明的是，港澳通行证只适用于到香港、澳门、台湾等地区旅游或商务活动，不适用于其他国家或地区。如果要到其他国家旅游，需要办理护照或其他相关的旅游签证。