根据提供的信息，住顶楼的住户并没有绝对的权力不让楼下住户在上楼顶种菜。以下是具体的理由：

屋顶作为共用部分：屋顶通常是整个建筑物的共用部分，所有业主都有权对其进行管理和使用。这意味着即使住在顶楼，也不能单方面决定禁止他人在其屋顶上进行合法活动，如种菜。