第一，遇到员工擅自离职的情况，用人单位应当及时以书面形式向员工送达《返岗通知书》，限定员工在指定的时间内回到公司上班工作，并明确说明在限期内仍拒不返岗的处理措施，包括停薪、警告等。

第二，若员工在限期内仍拒绝返岗，擅自离职的行为已经达到可依法解除劳动关系的标准，用人单位应当将解除劳动关系的事宜公开，并向该员工送达解除劳动关系的文书，通知该员工回公司办理工作交接以及离职手续。

关于上述的文书送达，建议用人单位采取EMS邮寄、微信通知、短信通知、电话通知多种形式并行，保证文书能够送达到位。若通过邮寄形式，员工拒不签收，或邮寄信被退回，用人单位应当完好保留邮寄信，若发生劳动争议，待开庭时再当仲裁员面前打开邮寄信，以证明用人单位履行了通知义务。

第三，如果员工擅自离职，没有办理工作交接手续，因此对公司造成损害，劳动者需承担相应的法律责任。员工离职应当严格履行法定程序，这也是维护自身权益的最好方式。