喀纳斯湖的颜色来自于湖水中溶解的矿物质和藻类的影响。由于该区域地质构造复杂，存在大量矿物质，湖水中的钙、镁等离子含量较高，形成了湖水的浑浊和绿色。

此外，湖水中还生长着大量的藻类，这些藻类会吸收阳光中的红、橙、黄等色彩，反射出蓝、绿、青等颜色，进一步加深了湖水的绿色。