书本因为运输过程中出现褶皱，商家应向消费者提供合理的补偿。根据相关法律法规，补偿费用应根据书本的实际价值和褶皱程度进行赔偿。一般情况下，商家可以提供部分退款或者更换完好的书本作为补偿。如果褶皱严重影响使用，消费者可以要求全额退款或者更换同等价值的书本。

在处理补偿问题时，商家应积极沟通，诚实对待消费者，尽力达成双方都能接受的解决方案。