特殊病种不仅限于门诊使用，根据具体情况可能需要在门诊、住院、或其他医疗机构进行治疗。特殊病种是指与其他疾病相比，治疗难度高、费用高、疗效难以保证的一类疾病。根据病情严重程度和治疗需求，医生可能会决定患者需要进行住院治疗或接受其他医疗服务。因此，特殊病种的治疗方式不仅仅局限于门诊治疗。具体的治疗方式需根据医生建议和患者病情决定。