根据目前的政策，46岁的人员可以申请灵活就业，但是否能够参加社保需要根据具体情况来判断。

如果申请灵活就业的人员是个体户，可以选择参加城乡居民养老保险和医疗保险；如果是企业和机关事业单位退休人员，可以选择缴纳养老保险和医疗保险；如果是无固定单位就业人员，则可能需要参加社保的补缴。总之，灵活就业人员如果想参加社保，应该根据本人的具体情况进行申请和咨询。