由公司缴纳。只要没有解除劳动关系,公司必须为员工缴纳社会保险,请假只会影响你的绩效工资和基本工资。

法律依据:《中华人民共和国社会保险法》第五十八条 用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。