山东新农合门诊慢性疾病的报销规则如下：

1、门、急诊医疗费用：在职职工年度内(1月1日~12月31日)符合基本医疗保险规定范围的医疗费累计超过2000元以上部分。

2、结算比例：合同期内派遣人员2000元以上部分报销50%，个人自付50%；在一个年度内累计支付派遣人员门、急诊报销最高数额为2万元。

3、最高支付限额基本医疗保险报销比例：甲类药品及普通诊疗费用在职职工统筹基金支付85%，退休人员统筹基金支付90%；乙类药品费用统筹基金支付75%；高精尖检查治疗费用统筹基金支付70%。

4、参保人员要妥善保管好在定点医院就诊的门诊医疗单据(含大额以下部分的收据、处方底方等)，作为医疗费用报销凭证。