违反交通信号灯扣6分，想要申诉不罚款，需要先确定自己是否是因为交通信号灯设置有问题，或者是因为交通监管设备存在技术误差和其他因素的干扰而导致的误判。如果确定是因为这些原因，可以通过以下方式进行申诉：

去当地车管所或交警大队：携带闯红灯车辆的行驶证、驾驶证，到车管所查询具体结果。如果确定有误判，可以提出申诉，经过审核和调查后，如果证据确凿，可以撤销相关的交通违规处罚。

通过“交管12123”APP申诉：进入APP后，在正上方点击“违法处理”，进入后看到自己的车辆信息及违章记录，点击“申诉”按钮，按照提示填写相关信息和上传证据，等待审核结果。

申诉的过程需要提供相关证据和事实，如视频、图片等，以证明自己的申诉是合理的。